成立背景：2008年，党的十七届三中全会明确提出，要创新农村金融体制，拓宽融资渠道，引导更多信贷和社会资金投向农村。2010年中央1号文件提出，要提高农村金融服务质量和水平，建立农业产业发展基金。
为贯彻落实2010年中央1号文件的要求，财政部于2011年5月向国务院上报了《财政部关于设立中国农业产业发展基金的请示》。2012年12月，国务院批复，同意财政部联合中国农业发展银行、中国信达资产管理股份有限公司、中国中信集团有限公司三家金融机构发起设立中国农业产业发展基金。2012年12月18日，基金正式成立。
2012年12月，国务院批复同意基金成立，并明确了基金的名称、目标、定位、资金规模、投资策略和管理方式，要求基金采取有限责任公司形式，按照现代企业制度规范，独立经营，自负盈亏。
截止2020年底，基金投资了21家农业龙头企业并积极引导社会资本跟投，带动了企业、行业、产业、地方和区域的发展，为群众脱贫致富作出了积极贡献。